Главная страница 2-го семестра

Мотивы в белке ALKH_Ecoli, описанные в БД Prosite

В таблице описаны все мотивы белка ALKH_Ecoli, найденные в PROSITE, в том числе неспецифичные (часто встречающиеся).

 

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Casein kinase II phosphorylation site паттерн [ST] - x(2) - [DE Непецифична 2
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Protein kinase C phosphorylation site   паттерн [ST] - x - [RK] Непецифична 1
PS00008 MYRISTYL N-myristoylation site   паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} Непецифична 4
PS0342 MICROBODIES_CTER Microbodies C-terminal targeting signal   паттерн [STAGCN] - [RKH] - [LIVMAFY]> Непецифична 1
PS00159 ALDOLASE_KDPG_KHG_1 KDPG and KHG aldolases active site паттерн G - [LIVM] - x(3) - E - [LIV] - T - [LF] - R Специфична 1
PS00160 ALDOLASE_KDPG_KHG_2 KDPG and KHG aldolases Schiff-base forming residue паттерн G - x(3) - [LIVMF] - K - [LF] - F - P - [SA] - x(3) - G Специфична 1

©Почашев Станислав